En el ICIM poseemos la infraestructura computacional necesaria para satisfacer las necesidades de análisis por parte de nuestros investigadores y colaboradores. El clúster computacional, denominado “Sofia” (del Griego “sabiduría”, FONDEQUIP EQM150093), es un computador de alto rendimiento destinado a optimizar el procesamiento de datos para realizar investigación en biomedicina. Siguiendo las corrientes actuales de cómputo a nivel mundial, Sofía, ha cambiado de una arquitectura de cluster, a una basada en máquinas virtuales (VM), delegando al usuario la elección del hardware que más se adapte a sus necesidades, así como la administración total del software y usuarios requeridos.
SABio está conformado por un equipo de investigadores y profesionales de la bioinformática, con experiencia en diversidad de tipos de análisis en genómica. SABio se pone a disposición del personal del ICIM, con el objetivo de entregar soporte y/o apoyo en:
784 CPU Cores
74 TB Storage
2 * 2880 GPU Cores
1.3 TB RAM
Los costos de utilizar Sofía, depende de los recursos computacionales solicitados. Los factores utilizados para el cálculo del costo total corresponden a CPU, Memoria RAM, Almacenamiento y/o GPU, los cuales poseen un valor fijo mensual. Para obtener detalles de los costos de cada ítem y disponibilidad, comuníquese con el equipo de administración de Sofía (ver sección de contactos).
| USO | MODELO | CANTIDAD | PROCESADOR | MEMORIA | ALMACENAMIENTO | CONECTIVIDAD |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Cómputo | Dell PowerEdge C6320 | 12 | Intel(R) Xeon(R) CPU E5-2695 v3 @ 2.30GHz | 96 GB | - | Gigabit |
| Cómputo | Dell PowerEdge C4130 | 2 | Intel(R) Xeon(R) CPU E5-2695 v3 @ 2.30GHz | 96 GB | - | Gigabit |
| Storage | Dell PowerEdge R630 | 1 | Intel(R) Xeon(R) CPU E5-2697 v3 @ 2.60GHz | 96 GB | 60x 2TB 7.2K RPM (RAID 5) | Gigabit |
Es una tecnología que permite la ejecución de varias máquinas virtuales sobre una misma máquina física. Su mayor ventaja es aprovechar al máximo los recursos de un sistema, impactando positivamente en su rendimiento. Cada máquina virtual es creada de manera aislada, con recursos propios (ram, cpu, gpu, storage) y un sistema operativo a elección. Sofía permite la creación de Máquina Virtuales con los siguientes topes de hardware p/VM (*): Max. CPU cores: 56 Max. GPU cores: 2880 cuda cores (min) Max. Memoria RAM: 96GB Max. Storage: 2TB (*) Sujeto a disponibilidad al momento de la solicitud.
Las políticas de uso del Clúster están publicadas en el siguiente link: Políticas de uso
¿Está interesado en utilizar Sofía? Escríbanos a bioinformatics@udd.cl
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Puedes contactarte con blabla@udd.cl
